L’Agence est administrée par un Conseil d’Administration composé comme suit :
- un représentant du Ministre ayant la Défense Nationale dans ses attributions ;
- un représentant du Ministre ayant les Télécommunications dans ses attributions ;
- un représentant du Ministre ayant les Finances dans ses attributions ;
- un représentant du Ministre ayant la Sécurité publique dans ses attributions ;
- un représentant du personnel de l’Agence, élu par ses pairs ;
- une personne choisie en raison de sa compétence particulière dans les domaine technique, juridique ou économique relevant du secteur des Technologies de l’Information et de la Communication;
- le Directeur Général de l’Agence, qui est le secrétaire du Conseil.
L’Agence comprend une Direction Générale et deux Directions : la Direction Technique ainsi que la Direction de la Régulation Economique, des Finances et des Ressources Humaines.
La Direction Technique coordonne quatre Services :
- le Service chargé de la normalisation, des réseaux et services ;
- le Service chargé de la Gestion et du Contrôle du Spectre des Fréquences ;
- le Service Informatique ;
- le Service des Etudes et Développement.
La Direction de la Régulation Economique, des Finances et des Ressources Humaines est composée de quatre Services :
- le Service Financier et Comptable ;
- le Service encadrement tarifaire et concurrence ;
- le Service des Affaires Juridiques et de la protection du consommateur ;
- le Service des Ressources Humaines et de la logistique.